110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4465 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  59.93 
 
 		 550 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  100 
 
 		 572 aa  1167    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  68.5 
 
 		 491 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  45.55 
 
 		 539 aa  432  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  44.58 
 
 		 542 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  44.24 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  41.29 
 
 		 531 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  44.86 
 
 		 639 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  42.44 
 
 		 563 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  39.43 
 
 		 593 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  43.22 
 
 		 529 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  40.07 
 
 		 574 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  39.1 
 
 		 591 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  39.1 
 
 		 581 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  39.1 
 
 		 581 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  40.19 
 
 		 530 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  42.57 
 
 		 622 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  41.88 
 
 		 533 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  39.66 
 
 		 561 aa  349  8e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  40 
 
 		 658 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  38.31 
 
 		 551 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  40.08 
 
 		 586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  40.08 
 
 		 586 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  39.56 
 
 		 589 aa  330  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  37.75 
 
 		 508 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  37.41 
 
 		 624 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  37.44 
 
 		 571 aa  316  9e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  38.03 
 
 		 606 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  36.8 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  34.36 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  35.45 
 
 		 641 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  37.89 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  37.93 
 
 		 518 aa  300  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  38 
 
 		 531 aa  286  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  36.06 
 
 		 548 aa  266  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  37.1 
 
 		 645 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  39.1 
 
 		 632 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  35.23 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  33.59 
 
 		 513 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  35.26 
 
 		 666 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  35.26 
 
 		 666 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  35.32 
 
 		 510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  34.38 
 
 		 578 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.66 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  40.85 
 
 		 643 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  33.52 
 
 		 531 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  32.55 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  51.09 
 
 		 524 aa  198  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  53.37 
 
 		 629 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  50.43 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  48.98 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  56.22 
 
 		 528 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  49.58 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  50 
 
 		 561 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  33.21 
 
 		 518 aa  186  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  42.48 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  56.05 
 
 		 188 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  41.48 
 
 		 544 aa  156  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  46.7 
 
 		 527 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  28.06 
 
 		 515 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  37.85 
 
 		 515 aa  104  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  28.35 
 
 		 450 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  48.28 
 
 		 261 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  52.78 
 
 		 262 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  52.78 
 
 		 262 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  23.06 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  25.05 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  29.27 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  22.32 
 
 		 432 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  25.55 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  25.9 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  36.89 
 
 		 485 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  40.4 
 
 		 946 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  37.61 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  31.3 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  24.48 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  36 
 
 		 932 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  33.33 
 
 		 673 aa  57  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  23.46 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  31.48 
 
 		 361 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  43.66 
 
 		 784 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  35.05 
 
 		 919 aa  54.3  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  44.44 
 
 		 1036 aa  53.9  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  31.62 
 
 		 330 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  30.7 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  31.3 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  43.64 
 
 		 413 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11770  S-layer domain protein  30.1 
 
 		 255 aa  50.4  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.175649  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  32.39 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  34.78 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  41.38 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.33 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0176  S-layer domain-containing protein  38.46 
 
 		 343 aa  47  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000342894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  40.74 
 
 		 1821 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  51.16 
 
 		 548 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18280  S-layer domain protein  29.17 
 
 		 186 aa  47  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000785925  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  24.51 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  29.61 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  40 
 
 		 468 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  53.85 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>