109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26321 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_26321  porin  100 
 
 		 543 aa  1090    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  60.39 
 
 		 531 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  59.93 
 
 		 513 aa  607  9.999999999999999e-173  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  58.93 
 
 		 555 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  57.17 
 
 		 510 aa  584  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  57.17 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  52.92 
 
 		 528 aa  510  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  49.36 
 
 		 518 aa  485  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  51.61 
 
 		 561 aa  474  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  47 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  45.86 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  52.59 
 
 		 475 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  99.35 
 
 		 188 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  38.3 
 
 		 515 aa  292  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  37.14 
 
 		 515 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  38.94 
 
 		 543 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  38.64 
 
 		 531 aa  266  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  34.83 
 
 		 544 aa  263  6e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  36.7 
 
 		 548 aa  259  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  35.82 
 
 		 574 aa  249  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  36.19 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  36.08 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  33.1 
 
 		 639 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  32.93 
 
 		 542 aa  227  5.0000000000000005e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  34.36 
 
 		 550 aa  223  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  35.73 
 
 		 561 aa  220  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  35.14 
 
 		 450 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  32.29 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  34.51 
 
 		 531 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  31.83 
 
 		 643 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  34 
 
 		 530 aa  210  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  32.89 
 
 		 624 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  33.83 
 
 		 491 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  36.44 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  32.72 
 
 		 629 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  31.77 
 
 		 571 aa  206  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  31.51 
 
 		 563 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  31.5 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  31.5 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  32.55 
 
 		 578 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  32.81 
 
 		 604 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  31.01 
 
 		 551 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  32.99 
 
 		 658 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  32.43 
 
 		 529 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  29.98 
 
 		 426 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  30.42 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  30.42 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  46.64 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  29.79 
 
 		 589 aa  176  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  44.22 
 
 		 622 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  29.2 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  30.92 
 
 		 591 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  29.56 
 
 		 432 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  30.34 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  30.25 
 
 		 550 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  32.26 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  40.15 
 
 		 641 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  41.46 
 
 		 666 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  41.46 
 
 		 666 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  28.8 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  30.69 
 
 		 409 aa  156  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  31.93 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  30.15 
 
 		 415 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  30.55 
 
 		 568 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  39.68 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  29.23 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  28.68 
 
 		 437 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  28.06 
 
 		 508 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  38.87 
 
 		 527 aa  140  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  38.08 
 
 		 645 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  32.25 
 
 		 440 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  28.65 
 
 		 449 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  37.29 
 
 		 632 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  30.3 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  26.48 
 
 		 383 aa  107  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3571  S-layer domain protein  31.94 
 
 		 262 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2542  S-layer domain protein  31.94 
 
 		 262 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.89792  normal  0.0876667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1122  S-layer domain protein  40.38 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  28.08 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  26.74 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  23.68 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  26.03 
 
 		 332 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  26.32 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  24.74 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1274  S-layer domain protein  37.23 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000376078  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  24.48 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  25.26 
 
 		 335 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  24.11 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  34.9 
 
 		 355 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  30.61 
 
 		 441 aa  54.3  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  61.11 
 
 		 399 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  26.24 
 
 		 384 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0331  S-layer-like protein region  32.69 
 
 		 946 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.491966  hitchhiker  0.00612825 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3655  S-layer domain protein  28.81 
 
 		 673 aa  52.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.2791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2990  S-layer domain-containing protein  31 
 
 		 932 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17460  S-layer domain protein  31.71 
 
 		 784 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  31.25 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  42.22 
 
 		 1036 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  36.67 
 
 		 361 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0107  S-layer domain protein  31.96 
 
 		 919 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000309483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>