84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13551 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  100 
 
 
432 aa  877    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  66.44 
 
 
432 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  58.18 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  52.89 
 
 
437 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  54.44 
 
 
415 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  42.99 
 
 
415 aa  317  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  40.86 
 
 
414 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  39.15 
 
 
515 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  37.05 
 
 
515 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.09 
 
 
514 aa  223  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  32.47 
 
 
524 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  33.18 
 
 
383 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  30.29 
 
 
513 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  31.55 
 
 
510 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  29.26 
 
 
555 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.62 
 
 
500 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  31.41 
 
 
371 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  28.39 
 
 
543 aa  156  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.19 
 
 
518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  30.95 
 
 
384 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  28.4 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  32.48 
 
 
431 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  30.49 
 
 
385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  29.1 
 
 
531 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  30.2 
 
 
399 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.82 
 
 
449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  31.66 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.22 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  27.87 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  26.35 
 
 
409 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  30.09 
 
 
369 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  25.9 
 
 
440 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  24.38 
 
 
384 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  28.47 
 
 
531 aa  93.6  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  26.41 
 
 
544 aa  91.3  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  27.54 
 
 
518 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  31.08 
 
 
450 aa  90.9  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  23.11 
 
 
491 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  25.85 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  27.69 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  29.33 
 
 
475 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  24.34 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  24.66 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  24.4 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  27.19 
 
 
336 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  24.89 
 
 
574 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  33.14 
 
 
639 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  23.94 
 
 
531 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  24.47 
 
 
530 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  24.08 
 
 
624 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  26.22 
 
 
533 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  23.57 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  24.57 
 
 
542 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  23.83 
 
 
548 aa  73.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  22.29 
 
 
581 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  30.3 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  23.11 
 
 
643 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  30.74 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.18 
 
 
572 aa  67  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  26.86 
 
 
550 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  24.18 
 
 
539 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  31.16 
 
 
551 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  23.67 
 
 
581 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  30.73 
 
 
658 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  23.67 
 
 
581 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  30.58 
 
 
529 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  24.95 
 
 
578 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  29.94 
 
 
589 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  31.43 
 
 
632 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  22.64 
 
 
622 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  31.43 
 
 
645 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  26.78 
 
 
563 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  36.26 
 
 
641 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  22.2 
 
 
508 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  29.3 
 
 
591 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  28.86 
 
 
568 aa  50.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  22.82 
 
 
604 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  27.85 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  33.72 
 
 
666 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  33.72 
 
 
666 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  33.72 
 
 
606 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  29.92 
 
 
629 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  29.14 
 
 
527 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  27.7 
 
 
188 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>