86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_13641 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  100 
 
 		 432 aa  880    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  66.44 
 
 		 432 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  58.86 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  52 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  54.32 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  42.83 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  40.31 
 
 		 414 aa  285  8e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  36.81 
 
 		 515 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  34.91 
 
 		 515 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  34.62 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  34.02 
 
 		 524 aa  230  4e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  29.81 
 
 		 513 aa  173  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  31.73 
 
 		 528 aa  170  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  32.1 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  30.08 
 
 		 500 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  29.64 
 
 		 555 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  30.13 
 
 		 510 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  29.2 
 
 		 543 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  30.86 
 
 		 383 aa  160  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  32.18 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  31.4 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  28.33 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  29.95 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  30.29 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  29.49 
 
 		 561 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  30.56 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  27.36 
 
 		 449 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  26.13 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  29.37 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  27.25 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  28.4 
 
 		 369 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  25.56 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  26.73 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  27.8 
 
 		 518 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  29.31 
 
 		 531 aa  103  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  25.05 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  31.03 
 
 		 475 aa  95.9  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  27.83 
 
 		 544 aa  89.4  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  25.05 
 
 		 624 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  27.11 
 
 		 543 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  25.16 
 
 		 571 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  26.56 
 
 		 533 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  25.57 
 
 		 548 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  24.38 
 
 		 335 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  25.57 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  24.12 
 
 		 639 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  24.41 
 
 		 530 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  24 
 
 		 550 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  26.13 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  25 
 
 		 574 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  24.18 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  24.05 
 
 		 561 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  33.1 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  25.23 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  23.69 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3604  Carbohydrate-selective porin OprB  24.66 
 
 		 591 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0134108 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  21.64 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  32.02 
 
 		 658 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0239  hypothetical protein  22.64 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000660522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3365  S-layer region-like  30.39 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.382297  normal  0.674286 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  23.84 
 
 		 643 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  24.09 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  31.33 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  33.6 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  29.94 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  23.41 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3648  Carbohydrate-selective porin OprB  31.17 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000847402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4223  Carbohydrate-selective porin OprB  23.44 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.747154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4184  Carbohydrate-selective porin OprB  23.44 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4705  Carbohydrate-selective porin OprB  22.35 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08801  hypothetical protein  29.14 
 
 		 188 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0023  major outer membrane protein  29.17 
 
 		 568 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.500646  normal  0.0378832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  27.54 
 
 		 551 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  29.27 
 
 		 581 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3603  Carbohydrate-selective porin OprB  23.73 
 
 		 593 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0055182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  35.56 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1445  Carbohydrate-selective porin OprB  36.17 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1471  Carbohydrate-selective porin OprB  30.67 
 
 		 632 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.633309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  32.81 
 
 		 629 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1923  S-layer domain protein  27.15 
 
 		 527 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0684445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1501  Carbohydrate-selective porin OprB  34.41 
 
 		 641 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.9541800000000004e-24 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  27.84 
 
 		 578 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4140  S-layer region-like  28.57 
 
 		 600 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0020254  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0443  Carbohydrate-selective porin OprB  30.11 
 
 		 666 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000473343  normal  0.0116841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0432  Carbohydrate-selective porin OprB  30.11 
 
 		 666 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  22.6 
 
 		 586 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>