71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18981 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_18981  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  795    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1028  hypothetical protein  91.41 
 
 		 409 aa  734    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1515  hypothetical protein  60.71 
 
 		 384 aa  478  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.116312  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1591  porin  32.63 
 
 		 528 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411467  hitchhiker  0.00286278 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0324  porin  34.29 
 
 		 510 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26321  porin  32.01 
 
 		 543 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0323  porin  32.55 
 
 		 513 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222297  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2012  porin  30.99 
 
 		 518 aa  159  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2367  porin  33.62 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14071  porin  30.85 
 
 		 531 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16211  porin-like protein  28.47 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.191112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11091  porin  27.58 
 
 		 555 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.559273 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0777  porin-like protein  27.91 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12581  hypothetical protein  28.53 
 
 		 515 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00206869 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2366  porin  28.92 
 
 		 561 aa  123  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.231063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1575  porin  28.32 
 
 		 514 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415305  normal  0.0658959 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13641  porin-like protein  26.13 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12591  hypothetical protein  27.3 
 
 		 515 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.375416  hitchhiker  0.00229564 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12111  hypothetical protein  27.53 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13341  porin  26.09 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13551  porin-like protein  27.87 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.564802  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1264  porin-like  25.56 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08291  hypothetical protein  29.25 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0885219  hitchhiker  0.0000555529 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1999  porin  26.15 
 
 		 524 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0137122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11511  porin  28.03 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0116362 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0440  porin-like protein  27.57 
 
 		 328 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1057  porin-like protein  27.71 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1757  porin-like protein  28.03 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1234  carbohydrate-selective porin OprB  24.46 
 
 		 639 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.373435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19301  hypothetical protein  28.21 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.665373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0838  carbohydrate-selective porin OprB  24.08 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.832217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1095  porin  26.56 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.319287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04791  hypothetical protein  27.46 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0282732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12261  porin  24.88 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12271  porin  25.6 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0833  porin  25.91 
 
 		 544 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039396  hitchhiker  0.000166509 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12121  porin  23.87 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0823  S-layer domain protein  26.52 
 
 		 578 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000211926  normal  0.0522919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1463  porin  26.01 
 
 		 543 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000578184  normal  0.0560138 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1130  porin precursor-like  24.71 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0788851  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1131  porin precursor-like  25.69 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00125322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1512  hypothetical protein  23.26 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.486809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0793  Carbohydrate-selective porin OprB  23.79 
 
 		 551 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2174  S-layer region-like  23.65 
 
 		 530 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.721353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2677  carbohydrate-selective porin OprB  26.48 
 
 		 571 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0200  hypothetical protein  25.56 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1635  porin; major outer membrane protein  24.93 
 
 		 548 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00492408  normal  0.132701 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12401  porin  23.98 
 
 		 449 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2437  hypothetical protein  23.16 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0721  porin precursor-like  24.76 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1464  porin  24.81 
 
 		 531 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000540569  normal  0.0535262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4515  carbohydrate-selective porin OprB  21.75 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0777365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4059  S-layer region-like  21.79 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000841951  normal  0.105376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  24.58 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1448  Carbohydrate-selective porin OprB  23.96 
 
 		 604 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2214  S-layer domain protein  23.15 
 
 		 643 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000900458  normal  0.0461421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12251  porin  21.77 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12271  porin  22.04 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2510  S-layer region-like  22.73 
 
 		 574 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000393409  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3779  carbohydrate-selective porin OprB  23.89 
 
 		 561 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000785609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4536  S-layer region-like  23.75 
 
 		 624 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4440  S-layer region-like  23.98 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.016737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4466  carbohydrate-selective porin OprB  28.32 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.666985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4567  carbohydrate-selective porin OprB  23.5 
 
 		 529 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.316045  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4247  S-layer domain protein  24.49 
 
 		 629 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000142849  unclonable  0.000000000425549 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1607  porin; major outer membrane protein  23.51 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.657278 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4465  carbohydrate-selective porin OprB  25.83 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00227345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2379  Carbohydrate-selective porin OprB  23.85 
 
 		 586 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.934978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2328  Carbohydrate-selective porin OprB  23.85 
 
 		 586 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1069  Carbohydrate-selective porin OprB  31.71 
 
 		 658 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000390313  unclonable  0.000000000285099 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2737  carbohydrate-selective porin OprB  22.8 
 
 		 542 aa  43.9  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000147214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>