23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0272 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  100 
 
 		 434 aa  837    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1533  hypothetical protein  28.74 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.135792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0219  S-layer domain-containing protein  23.42 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0217  S-layer domain-containing protein  23.42 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  25.83 
 
 		 361 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  22.05 
 
 		 694 aa  66.6  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  25.29 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  20.52 
 
 		 1362 aa  63.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  24.75 
 
 		 1036 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  15.83 
 
 		 567 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0017  hypothetical protein  23.74 
 
 		 686 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  17.1 
 
 		 1235 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  22.51 
 
 		 468 aa  50.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  25.75 
 
 		 1185 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  19.55 
 
 		 1487 aa  47.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  32.38 
 
 		 143 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  21.67 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1053  GAF sensor hybrid histidine kinase  16.77 
 
 		 1458 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  25.27 
 
 		 978 aa  43.5  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  20.42 
 
 		 349 aa  43.5  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf150  massive surface protein MspI  25.45 
 
 		 2416 aa  43.5  0.008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  18.15 
 
 		 702 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  24.39 
 
 		 1195 aa  43.1  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>