16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05450 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  687    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  50.27 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  27.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  28.48 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  26.32 
 
 		 708 aa  53.1  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  27.21 
 
 		 178 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1887  syntaxin domain-containing protein  28.12 
 
 		 172 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.546042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.72 
 
 		 1235 aa  46.6  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  26.42 
 
 		 567 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  23.78 
 
 		 143 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.44 
 
 		 1153 aa  46.2  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1587 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  27.78 
 
 		 2327 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  20.42 
 
 		 434 aa  43.5  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  19.62 
 
 		 1036 aa  42.7  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>