22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6447 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  805    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  51.08 
 
 		 349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.91 
 
 		 1153 aa  70.1  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  24.93 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  27.22 
 
 		 209 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  30.08 
 
 		 143 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0617  hypothetical protein  25.42 
 
 		 226 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  0.391566 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  31.67 
 
 		 257 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  27.78 
 
 		 745 aa  50.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2240  hypothetical protein  25.25 
 
 		 3036 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  30.57 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  24.56 
 
 		 229 aa  47.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  22.9 
 
 		 178 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.81 
 
 		 2487 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  25.39 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  29.45 
 
 		 356 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.77 
 
 		 1235 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  25.77 
 
 		 1652 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  25.84 
 
 		 187 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  26.6 
 
 		 335 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3500  hypothetical protein  21.95 
 
 		 199 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1587 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>