42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0557 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1852  chromosome segregation ATPase-like protein  40.76 
 
 		 380 aa  133  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.518823  normal  0.814209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2214  Protein of unknown function DUF1626  46.21 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.346071  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1768  hypothetical protein  34.11 
 
 		 385 aa  92  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1343  chromosome segregation ATPases-like  33.02 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  46.07 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0621  hypothetical protein  44.79 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149956  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  37.06 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  46.59 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3828  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.81 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0692  hypothetical protein  48.86 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  28.47 
 
 		 178 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  26.94 
 
 		 567 aa  53.1  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  29.09 
 
 		 209 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  21.01 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  22.3 
 
 		 1174 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2946  FkbM family methyltransferase  27.6 
 
 		 786 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50506  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3994  phage protein  20.59 
 
 		 1660 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0387  hypothetical protein  35.85 
 
 		 251 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0788  phage tape measure protein  22.56 
 
 		 866 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0644  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.59 
 
 		 450 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_18871  predicted protein  27.57 
 
 		 1682 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00445245  hitchhiker  0.0000013419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1101  hypothetical protein  50.98 
 
 		 157 aa  46.2  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.42 
 
 		 1196 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  29.45 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  19.64 
 
 		 1164 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1070  TP901 family phage tail tape measure protein  18.64 
 
 		 2066 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.917843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1091  TP901 family phage tail tape measure protein  18.64 
 
 		 2066 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  20.82 
 
 		 1991 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0004  phage tail tape measure protein, TP901 family, core region domain protein  21.26 
 
 		 1178 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.64 
 
 		 1235 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  20.18 
 
 		 1049 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2947  hypothetical protein  26.52 
 
 		 144 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3258  cadherin  24.71 
 
 		 2454 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  17.95 
 
 		 1185 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1497  chromosome segregation ATPase-like protein  19.79 
 
 		 1209 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.440626 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30460  structural maintenance of chromosomes protein  24.02 
 
 		 1093 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.157057 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  20 
 
 		 1184 aa  42.7  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  20 
 
 		 657 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  31.3 
 
 		 745 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  28.08 
 
 		 243 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2658  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 328 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0299306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>