26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2601 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  100 
 
 		 708 aa  1357    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  45.6 
 
 		 745 aa  529  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  35.52 
 
 		 386 aa  141  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0617  hypothetical protein  40.34 
 
 		 226 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.492305  normal  0.391566 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1993 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  22.91 
 
 		 2335 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1874 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4464  hypothetical protein  34.44 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.481573  normal  0.141209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6447  hypothetical protein  24.86 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1799 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1850 aa  54.7  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.87 
 
 		 1235 aa  54.3  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  26.32 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  26.9 
 
 		 209 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  21.03 
 
 		 2115 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  32.31 
 
 		 257 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  29.31 
 
 		 212 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1101  hypothetical protein  24.35 
 
 		 229 aa  49.3  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.558876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  25.23 
 
 		 178 aa  47.8  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1981 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1587 aa  47  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1652 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  29.14 
 
 		 2487 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  24.24 
 
 		 177 aa  45.8  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  20.87 
 
 		 2025 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  20.9 
 
 		 550 aa  44.3  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>