86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1614 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 
1235 aa  2263    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  36.7 
 
 
1153 aa  403  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0442  hypothetical protein  36.86 
 
 
354 aa  163  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.836866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1801  hypothetical protein  34.89 
 
 
342 aa  151  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3586  hypothetical protein  34.56 
 
 
341 aa  147  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  27.42 
 
 
3608 aa  84.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.478087 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  19.71 
 
 
7659 aa  77.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0715  S-layer domain-containing protein  19.76 
 
 
1036 aa  67.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  26.65 
 
 
386 aa  65.1  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  27.91 
 
 
1193 aa  64.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25.57 
 
 
2327 aa  63.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0047  S-layer domain-containing protein  22.51 
 
 
468 aa  63.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498121  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.46 
 
 
1196 aa  60.1  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  26.6 
 
 
1587 aa  60.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0863  S-layer domain protein  26.75 
 
 
694 aa  60.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000121904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  19.35 
 
 
2228 aa  59.7  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05499  Nuclear pore complex protein An-Mlp1 (Eurofung)  23.15 
 
 
2064 aa  58.5  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.481853 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  30.22 
 
 
209 aa  58.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  28.74 
 
 
745 aa  56.2  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  56.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  26.81 
 
 
2487 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  21.61 
 
 
1185 aa  55.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  24.27 
 
 
2252 aa  55.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  23.53 
 
 
278 aa  54.7  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  26.98 
 
 
243 aa  54.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  24.93 
 
 
1181 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  30.13 
 
 
567 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  23.66 
 
 
708 aa  54.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  27.7 
 
 
2797 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  27.7 
 
 
2797 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  17.49 
 
 
1362 aa  54.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 
997 aa  53.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0443  S-layer domain-containing protein  22.81 
 
 
400 aa  53.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000189503  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  25.86 
 
 
1059 aa  53.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  22.73 
 
 
2115 aa  52.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0522  hypothetical protein  24 
 
 
2166 aa  52.8  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0380  hypothetical protein  24 
 
 
417 aa  51.6  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  25.71 
 
 
926 aa  51.6  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0527  hypothetical protein  26.63 
 
 
178 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0259802  normal  0.0608091 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2293  hypothetical protein  20.64 
 
 
1081 aa  51.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  17.1 
 
 
434 aa  51.2  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  19.05 
 
 
361 aa  50.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  25.94 
 
 
2665 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  22.14 
 
 
1217 aa  50.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0458  S-layer domain-containing protein  20.75 
 
 
400 aa  50.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000061041  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1075  chromosome segregation ATPase-like protein  20.86 
 
 
1206 aa  50.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0842  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 
732 aa  50.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  26.02 
 
 
1074 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15401  predicted protein  23.16 
 
 
1242 aa  50.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.388188  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0861  hypothetical protein  20.48 
 
 
753 aa  50.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.310988  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  23.74 
 
 
1164 aa  49.7  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  25.7 
 
 
357 aa  49.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0860  hypothetical protein  18.43 
 
 
752 aa  48.9  0.0006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.294575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  24.63 
 
 
1874 aa  48.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  22.51 
 
 
1059 aa  48.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  24.04 
 
 
335 aa  48.5  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  28.27 
 
 
2955 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  25.21 
 
 
2335 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.93 
 
 
833 aa  47.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  26.01 
 
 
3296 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0398  chromosome segregation ATPase-like protein  24.81 
 
 
1314 aa  47.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  26.72 
 
 
349 aa  47  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1012  hypothetical protein  14.06 
 
 
627 aa  47.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1174  hypothetical protein  21.75 
 
 
682 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.37094  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3638  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.09 
 
 
576 aa  47  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  20.88 
 
 
1190 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.4 
 
 
753 aa  46.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  23.82 
 
 
1086 aa  46.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2616  hypothetical protein  24.38 
 
 
188 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.145924  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0326  paREP15, putative coiled-coil protein  23.3 
 
 
194 aa  45.8  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0971098  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0384  hypothetical protein  23.46 
 
 
758 aa  46.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000355497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0956  hypothetical protein  20.13 
 
 
1234 aa  46.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0400  hypothetical protein  23.46 
 
 
758 aa  45.8  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000863332  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.45 
 
 
1066 aa  45.8  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.00761831 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.81 
 
 
1543 aa  45.4  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  24.84 
 
 
2331 aa  45.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  23.44 
 
 
1981 aa  45.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  23.82 
 
 
1186 aa  45.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0246  hypothetical protein  33.04 
 
 
212 aa  45.4  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03870  myosin heavy chain, putative  23.16 
 
 
803 aa  45.4  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  29.61 
 
 
356 aa  45.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.25 
 
 
1261 aa  45.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0204  hypothetical protein  23.55 
 
 
438 aa  45.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0209978  normal  0.189002 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  21.81 
 
 
441 aa  45.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  18.56 
 
 
1177 aa  45.1  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1104  chromosome segregation ATPase-like protein  21.6 
 
 
1359 aa  45.1  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>