35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1641 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  54.4 
 
 		 1799 aa  1285    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  71.59 
 
 		 2025 aa  2895    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  75.65 
 
 		 1981 aa  2981    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  62.77 
 
 		 1993 aa  2424    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 2115 aa  4155    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  54.5 
 
 		 1850 aa  1342    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  55.7 
 
 		 1874 aa  1391    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1411 aa  324  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  30.14 
 
 		 2327 aa  303  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2797 aa  250  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  37.26 
 
 		 2955 aa  249  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1582 aa  248  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  28.88 
 
 		 2016 aa  247  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  30.42 
 
 		 2797 aa  248  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  33.39 
 
 		 1557 aa  248  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.73 
 
 		 2487 aa  246  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  28.46 
 
 		 2052 aa  243  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1652 aa  233  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  28.24 
 
 		 2665 aa  230  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  30.84 
 
 		 1587 aa  229  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  25.71 
 
 		 2331 aa  228  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  25.89 
 
 		 2335 aa  227  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  36.09 
 
 		 3296 aa  224  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  25.3 
 
 		 2252 aa  196  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1543 aa  129  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  29.84 
 
 		 764 aa  117  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1099 aa  60.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  30.91 
 
 		 787 aa  55.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  15.98 
 
 		 7659 aa  54.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  31.48 
 
 		 810 aa  54.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1450 aa  52  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  26.88 
 
 		 691 aa  52.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  27.14 
 
 		 864 aa  48.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  25 
 
 		 1153 aa  47  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  22.03 
 
 		 708 aa  45.8  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>