39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1219 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1219  hypothetical protein  100 
 
 
567 aa  1064    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000368049 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3590  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) domain-like  42.5 
 
 
740 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1806  hypothetical protein  40.79 
 
 
595 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2497  hypothetical protein  41.29 
 
 
396 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.826338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2541  hypothetical protein  42.76 
 
 
381 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0140  PKD domain containing protein  17 
 
 
1362 aa  62.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3196  hypothetical protein  25.51 
 
 
209 aa  60.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0272  S-layer domain-containing protein  15.83 
 
 
434 aa  57.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1737  hypothetical protein  26.25 
 
 
257 aa  53.5  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.332134  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1337  hypothetical protein  21.88 
 
 
335 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.629526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0557  hypothetical protein  26.94 
 
 
356 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  20 
 
 
2228 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4392  BRCT domain protein  16.67 
 
 
783 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1088  hypothetical protein  39.22 
 
 
135 aa  50.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  22.15 
 
 
923 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  21.81 
 
 
924 aa  50.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  19.07 
 
 
526 aa  50.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0063  hypothetical protein  21.98 
 
 
179 aa  48.9  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.261696  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1624  S-layer domain-containing protein  20.23 
 
 
330 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00805095  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1276  hypothetical protein  32.91 
 
 
177 aa  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.370677  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  30.13 
 
 
1235 aa  47.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  18.12 
 
 
1621 aa  47.4  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2563  conserved hypothetical protein  23.08 
 
 
323 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.530056  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  17.46 
 
 
746 aa  46.6  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0924  virulence factor Mce family protein  23.92 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.841372 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1997  hypothetical protein  20.51 
 
 
278 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0605  hypothetical protein  22.29 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1177  coiled-coil protein  23.32 
 
 
243 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  16.58 
 
 
1185 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  24.9 
 
 
458 aa  45.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05450  hypothetical protein  26.02 
 
 
349 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01670  hypothetical protein  26.83 
 
 
515 aa  44.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.405455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  25.3 
 
 
458 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1151  hypothetical protein  27.96 
 
 
386 aa  44.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  23.56 
 
 
456 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0786  cell wall anchor domain-containing protein  15.05 
 
 
317 aa  43.9  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  25 
 
 
477 aa  43.9  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0876  paREP15, putative coiled-coil protein  26.28 
 
 
150 aa  43.5  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0299  coiled-coil protein  23.4 
 
 
146 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>