35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2239 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  47.28 
 
 		 2331 aa  1878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 2252 aa  4458    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 		 2052 aa  1015    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  46.31 
 
 		 2335 aa  1865    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  27.18 
 
 		 2327 aa  459  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1557 aa  456  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1582 aa  451  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1587 aa  350  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1652 aa  350  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  25.96 
 
 		 2797 aa  308  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  24.49 
 
 		 2797 aa  307  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1411 aa  303  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  24.59 
 
 		 2665 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  24.33 
 
 		 2016 aa  252  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  25.63 
 
 		 2955 aa  248  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  23.09 
 
 		 2115 aa  244  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1981 aa  241  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  24.76 
 
 		 2487 aa  234  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1543 aa  223  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1799 aa  223  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.91 
 
 		 2025 aa  221  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  27.22 
 
 		 1993 aa  216  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1874 aa  204  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  25 
 
 		 1850 aa  196  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  51.28 
 
 		 3296 aa  169  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  29.96 
 
 		 764 aa  167  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.78 
 
 		 1523 aa  89.4  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  38.46 
 
 		 864 aa  87.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.63 
 
 		 1454 aa  85.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  36.44 
 
 		 810 aa  82.8  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1099 aa  82  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  33.04 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  23.72 
 
 		 1235 aa  53.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.78 
 
 		 691 aa  52.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  21.75 
 
 		 1009 aa  46.2  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0724205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>