34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4123 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  100 
 
 		 1411 aa  2806    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  28.71 
 
 		 2327 aa  353  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1993 aa  338  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1981 aa  331  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  31.15 
 
 		 2115 aa  329  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  29 
 
 		 1850 aa  328  7e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  29.32 
 
 		 1874 aa  324  7e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1799 aa  322  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.03 
 
 		 2025 aa  318  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  28.69 
 
 		 2797 aa  315  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  28.5 
 
 		 2797 aa  311  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1587 aa  292  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1557 aa  291  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1582 aa  291  5.0000000000000004e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  27.59 
 
 		 2665 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  25.11 
 
 		 2252 aa  284  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  26.49 
 
 		 2335 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  28.09 
 
 		 2955 aa  272  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1652 aa  270  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  26.89 
 
 		 2331 aa  268  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  33.11 
 
 		 2487 aa  264  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  24.88 
 
 		 2016 aa  262  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  29.93 
 
 		 3296 aa  248  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  24.22 
 
 		 2052 aa  244  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  19.57 
 
 		 1543 aa  180  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  28.52 
 
 		 764 aa  155  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1099 aa  75.1  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  34.23 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  35.19 
 
 		 810 aa  72.4  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  31.53 
 
 		 787 aa  67.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2389  hypothetical protein  30.37 
 
 		 357 aa  52.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.72 
 
 		 691 aa  51.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1751  hypothetical protein  31.09 
 
 		 973 aa  46.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03680  conserved hypothetical protein  25.66 
 
 		 1826 aa  45.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.634072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>