36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1318 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  68.48 
 
 		 1874 aa  2440    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  80.15 
 
 		 1799 aa  2835    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  63.15 
 
 		 2025 aa  2339    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  65.19 
 
 		 1981 aa  2429    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 1850 aa  3662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  64.13 
 
 		 1993 aa  2367    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  60.08 
 
 		 2115 aa  1477    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  26.4 
 
 		 2016 aa  425  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1411 aa  331  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  29.97 
 
 		 2327 aa  275  7e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  37.19 
 
 		 2955 aa  255  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.91 
 
 		 2487 aa  254  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  31.16 
 
 		 2797 aa  252  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  31.09 
 
 		 2797 aa  251  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  24.47 
 
 		 2052 aa  249  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  28.95 
 
 		 2665 aa  234  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  37.27 
 
 		 3296 aa  234  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  29.15 
 
 		 1557 aa  230  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1582 aa  229  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1652 aa  228  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  26.92 
 
 		 2331 aa  218  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  25.82 
 
 		 2335 aa  218  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  27.03 
 
 		 1587 aa  209  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  25.89 
 
 		 2252 aa  192  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.01 
 
 		 1543 aa  129  8.000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  25.35 
 
 		 764 aa  106  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1099 aa  59.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.5 
 
 		 691 aa  53.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  29.46 
 
 		 787 aa  52.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1240  hypothetical protein  29.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1397  hypothetical protein  22.04 
 
 		 442 aa  50.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0479403  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  23.68 
 
 		 708 aa  49.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  28.83 
 
 		 810 aa  47.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.67 
 
 		 7659 aa  47.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  23.86 
 
 		 520 aa  46.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  27.93 
 
 		 864 aa  45.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>