28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2000 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1367    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1751  hypothetical protein  26.17 
 
 		 973 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  23.91 
 
 		 764 aa  83.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1850 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  29.08 
 
 		 2335 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1981 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1874 aa  53.9  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  30.13 
 
 		 2955 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  27.86 
 
 		 2797 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2797 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1799 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1993 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  25.75 
 
 		 2115 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  26.23 
 
 		 2331 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  27.78 
 
 		 2252 aa  51.6  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1411 aa  51.6  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.76 
 
 		 2487 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  28.07 
 
 		 2327 aa  51.2  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  28.32 
 
 		 2665 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 2052 aa  50.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1587 aa  50.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1582 aa  50.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  27.7 
 
 		 2016 aa  49.7  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1652 aa  49.7  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1557 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  34.29 
 
 		 3296 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1099 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.18 
 
 		 2025 aa  45.8  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>