34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2187 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  85.03 
 
 		 2335 aa  3765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 		 2052 aa  922    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  46.58 
 
 		 2252 aa  1878    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 2331 aa  4574    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1557 aa  427  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  30.74 
 
 		 1582 aa  427  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1652 aa  417  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1587 aa  348  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25.27 
 
 		 2327 aa  330  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1411 aa  305  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  24.97 
 
 		 2797 aa  293  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  23.88 
 
 		 2797 aa  293  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  25.03 
 
 		 2016 aa  289  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  23.52 
 
 		 1993 aa  284  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  25.48 
 
 		 2665 aa  283  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  25.02 
 
 		 2955 aa  282  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1799 aa  249  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1850 aa  230  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  26.86 
 
 		 2115 aa  228  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.37 
 
 		 2025 aa  226  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1981 aa  223  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1874 aa  214  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.72 
 
 		 1543 aa  198  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  23.39 
 
 		 3296 aa  177  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  28.2 
 
 		 764 aa  160  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  46.2 
 
 		 2487 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  40.18 
 
 		 864 aa  87.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  37.29 
 
 		 810 aa  82  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1099 aa  80.5  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.32 
 
 		 7659 aa  73.9  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  33.04 
 
 		 787 aa  73.2  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  24.59 
 
 		 785 aa  56.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  29.85 
 
 		 497 aa  53.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.95 
 
 		 691 aa  50.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>