40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1538 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 2052 aa  4019    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  35.85 
 
 		 2331 aa  1162    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  35.81 
 
 		 2252 aa  1115    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  36.2 
 
 		 2335 aa  950    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1993 aa  423  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  25.38 
 
 		 2016 aa  395  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1582 aa  375  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1557 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  28.97 
 
 		 1587 aa  363  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1652 aa  351  7e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  25.33 
 
 		 2665 aa  301  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  25.48 
 
 		 2797 aa  296  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  25.46 
 
 		 2797 aa  295  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  26.03 
 
 		 2955 aa  290  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25.46 
 
 		 2327 aa  251  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  25.38 
 
 		 2487 aa  248  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1411 aa  248  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  28.6 
 
 		 1981 aa  244  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  28.09 
 
 		 2115 aa  239  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1799 aa  239  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  28.02 
 
 		 1850 aa  231  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.57 
 
 		 2025 aa  219  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1874 aa  213  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.3 
 
 		 1543 aa  194  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  29.55 
 
 		 3296 aa  184  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  27.31 
 
 		 764 aa  160  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  39.29 
 
 		 864 aa  85.9  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  37.29 
 
 		 810 aa  82  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1099 aa  79.7  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  33.93 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0522  hypothetical protein  18.84 
 
 		 2166 aa  61.2  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  19.91 
 
 		 7659 aa  57.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2247  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1705 aa  57  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  28.31 
 
 		 691 aa  51.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  23.66 
 
 		 745 aa  49.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2293  hypothetical protein  21.09 
 
 		 1081 aa  48.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1752  RepA / Rep+ protein KID  27.72 
 
 		 187 aa  48.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000570014  normal  0.986546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 897 aa  45.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  27.08 
 
 		 897 aa  45.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1284  hypothetical protein  21.7 
 
 		 637 aa  45.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000117205  decreased coverage  0.00000270892 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>