32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1024 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  100 
 
 		 1557 aa  3091    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  79.66 
 
 		 1587 aa  2390    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  99.42 
 
 		 1582 aa  3072    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1652 aa  892    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  27 
 
 		 1543 aa  594  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  30.34 
 
 		 2252 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.65 
 
 		 1411 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  29.93 
 
 		 2335 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 2052 aa  365  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  27.9 
 
 		 2331 aa  337  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  26.86 
 
 		 2797 aa  304  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  27.26 
 
 		 2487 aa  303  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  26.46 
 
 		 2797 aa  301  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  27.11 
 
 		 2665 aa  286  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  26.52 
 
 		 2327 aa  282  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  26.3 
 
 		 2955 aa  279  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1993 aa  259  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1799 aa  249  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  32.57 
 
 		 2115 aa  248  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1981 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1874 aa  234  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.09 
 
 		 2025 aa  230  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  25.16 
 
 		 2016 aa  229  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  28.86 
 
 		 1850 aa  228  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  55.17 
 
 		 3296 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  35.64 
 
 		 764 aa  166  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  37.29 
 
 		 864 aa  86.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  35.38 
 
 		 810 aa  83.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1099 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  35.4 
 
 		 787 aa  80.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  19.47 
 
 		 7659 aa  70.1  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.56 
 
 		 691 aa  50.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>