35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1408 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  37.09 
 
 		 1557 aa  882    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  38.33 
 
 		 1587 aa  882    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1582 aa  885    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  100 
 
 		 1652 aa  3273    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  25.87 
 
 		 1543 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  27.06 
 
 		 2252 aa  345  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  28.74 
 
 		 2052 aa  345  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  28.04 
 
 		 2797 aa  308  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  27.97 
 
 		 2797 aa  305  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  27.78 
 
 		 2335 aa  294  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  27.62 
 
 		 2331 aa  293  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25.23 
 
 		 2327 aa  280  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2665 aa  275  8.000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1411 aa  266  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  25.75 
 
 		 2955 aa  254  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  24.23 
 
 		 2016 aa  249  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  27.73 
 
 		 2115 aa  236  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  27.77 
 
 		 1981 aa  232  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1993 aa  230  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  27.9 
 
 		 1799 aa  222  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1874 aa  218  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.32 
 
 		 2025 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1850 aa  216  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  25.12 
 
 		 2487 aa  208  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  53.15 
 
 		 3296 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  36.12 
 
 		 764 aa  155  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  39.47 
 
 		 864 aa  89.4  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  37.72 
 
 		 810 aa  80.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  36.61 
 
 		 787 aa  80.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1099 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4028  hypothetical protein  21.97 
 
 		 745 aa  57.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  20.49 
 
 		 7659 aa  52.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  26.54 
 
 		 691 aa  50.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.68 
 
 		 1261 aa  45.8  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2809  chromosome segregation ATPase-like protein  21.55 
 
 		 2228 aa  45.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>