33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1086 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  100 
 
 		 1799 aa  3571    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  57.61 
 
 		 2025 aa  2043    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  59.11 
 
 		 1981 aa  2131    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  59.88 
 
 		 1993 aa  2187    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  59.41 
 
 		 2115 aa  1429    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  81.77 
 
 		 1850 aa  2897    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  66.56 
 
 		 1874 aa  2338    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1411 aa  326  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  30.95 
 
 		 2327 aa  292  5.0000000000000004e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  31.88 
 
 		 2797 aa  261  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1557 aa  259  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  31.74 
 
 		 1582 aa  259  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  29.13 
 
 		 2487 aa  259  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  32.52 
 
 		 2797 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  30.76 
 
 		 2665 aa  246  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  36.51 
 
 		 2955 aa  244  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  25.2 
 
 		 2052 aa  232  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  24.07 
 
 		 2331 aa  227  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1652 aa  225  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  35.81 
 
 		 3296 aa  225  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  30.53 
 
 		 2016 aa  221  8.999999999999998e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  26.15 
 
 		 2252 aa  213  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  26.6 
 
 		 2335 aa  204  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1587 aa  192  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1543 aa  135  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  26.52 
 
 		 764 aa  128  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1099 aa  62  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.94 
 
 		 7659 aa  55.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 		 1519 aa  53.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  29.09 
 
 		 787 aa  53.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.5 
 
 		 691 aa  52.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  22.85 
 
 		 708 aa  52  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  27.78 
 
 		 810 aa  48.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>