35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2348 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 2016 aa  4003    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  30.11 
 
 		 2327 aa  621  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  25.89 
 
 		 2025 aa  438  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  24 
 
 		 2252 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  25.71 
 
 		 2487 aa  336  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  25.24 
 
 		 2955 aa  292  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  24.5 
 
 		 2797 aa  283  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  24.03 
 
 		 2797 aa  276  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  35.1 
 
 		 2665 aa  273  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  24.59 
 
 		 2335 aa  270  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1411 aa  262  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  27.77 
 
 		 2115 aa  257  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  34.16 
 
 		 3296 aa  253  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  24.52 
 
 		 2331 aa  250  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1874 aa  248  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1652 aa  244  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1850 aa  244  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1587 aa  241  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  28.18 
 
 		 1981 aa  239  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  26.31 
 
 		 1993 aa  237  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  23.41 
 
 		 2052 aa  236  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  25.12 
 
 		 1557 aa  231  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1582 aa  230  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1799 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.03 
 
 		 1543 aa  143  3.9999999999999997e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  28.69 
 
 		 764 aa  88.6  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1099 aa  58.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  31.85 
 
 		 787 aa  53.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  29.41 
 
 		 810 aa  53.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  16.56 
 
 		 7659 aa  50.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  27.33 
 
 		 691 aa  50.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  29.41 
 
 		 864 aa  47.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 577 aa  47.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2914  hypothetical protein  34.83 
 
 		 154 aa  46.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1290  preprotein translocase, SecA subunit  24.75 
 
 		 916 aa  45.8  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.793107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>