34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3216 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  100 
 
 		 1099 aa  2157    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  35.4 
 
 		 2252 aa  82.4  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1557 aa  82  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1582 aa  82  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  36.21 
 
 		 1587 aa  81.6  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  35.4 
 
 		 2335 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  33.06 
 
 		 764 aa  81.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  36.28 
 
 		 2331 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1652 aa  80.1  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 		 2052 aa  79.7  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  25.6 
 
 		 810 aa  78.2  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  23.4 
 
 		 864 aa  76.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1411 aa  75.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  25 
 
 		 787 aa  70.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  33.94 
 
 		 2665 aa  64.7  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  33.03 
 
 		 2797 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  35.71 
 
 		 3296 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  33.03 
 
 		 2797 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1993 aa  63.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  36.28 
 
 		 2487 aa  62  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1981 aa  62  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1799 aa  61.6  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  34.82 
 
 		 2955 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2115 aa  60.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1850 aa  59.7  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1874 aa  59.3  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 2025 aa  58.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  30.53 
 
 		 2016 aa  58.2  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  25 
 
 		 2327 aa  50.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  18.68 
 
 		 1543 aa  50.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.78 
 
 		 793 aa  47.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  22.54 
 
 		 691 aa  47  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.77 
 
 		 573 aa  46.2  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1542  hypothetical protein  27.14 
 
 		 458 aa  45.8  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.133417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>