33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2516 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1504    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1582 aa  165  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1557 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  29.27 
 
 		 2252 aa  163  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1587 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1411 aa  160  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1652 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 		 2052 aa  157  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  50.44 
 
 		 2335 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  49.56 
 
 		 2331 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  25.96 
 
 		 1799 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  27.05 
 
 		 2797 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  26.82 
 
 		 2797 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  26.01 
 
 		 2665 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  31.08 
 
 		 2025 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1981 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1874 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  29.84 
 
 		 2115 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1993 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  43.22 
 
 		 3296 aa  112  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  29.49 
 
 		 2955 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  24.4 
 
 		 1850 aa  111  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  30.07 
 
 		 2327 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  42.59 
 
 		 2487 aa  102  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1543 aa  94.4  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  28.69 
 
 		 2016 aa  87.8  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  39.02 
 
 		 864 aa  84  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  23.17 
 
 		 1099 aa  81.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  34.25 
 
 		 810 aa  80.5  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  23.35 
 
 		 691 aa  77  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  35.16 
 
 		 787 aa  67  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1751  hypothetical protein  33.87 
 
 		 973 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 748 aa  44.3  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>