36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1455 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  55.75 
 
 		 1874 aa  1585    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  65.5 
 
 		 2025 aa  2484    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  58.12 
 
 		 1850 aa  1645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  63.81 
 
 		 2115 aa  2479    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  100 
 
 		 1993 aa  3934    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  63.62 
 
 		 1981 aa  2402    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  52.95 
 
 		 1799 aa  1447    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  27.35 
 
 		 2052 aa  419  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1411 aa  323  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  32.34 
 
 		 2327 aa  310  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  31.18 
 
 		 2797 aa  266  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  32.32 
 
 		 2797 aa  264  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1557 aa  255  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1582 aa  254  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  37.82 
 
 		 2955 aa  249  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  29.35 
 
 		 2665 aa  249  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  28.5 
 
 		 2487 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  37.45 
 
 		 3296 aa  238  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  22.78 
 
 		 2331 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  26.73 
 
 		 2016 aa  235  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1652 aa  228  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  25.04 
 
 		 2335 aa  225  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  24.89 
 
 		 2252 aa  214  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1587 aa  199  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1543 aa  135  7.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  29.79 
 
 		 764 aa  116  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.56 
 
 		 7659 aa  67.8  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1099 aa  63.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  22.5 
 
 		 708 aa  60.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  31.48 
 
 		 810 aa  55.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  30.91 
 
 		 787 aa  55.5  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  25.62 
 
 		 691 aa  51.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  29.63 
 
 		 864 aa  51.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 1450 aa  50.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011720  BbuZS7_AC60  BdrE  19.08 
 
 		 210 aa  47.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000600085  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  25.5 
 
 		 520 aa  45.8  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>