35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6067 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  37.26 
 
 		 2797 aa  1010    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  34.8 
 
 		 2487 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  100 
 
 		 3296 aa  6036    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  35 
 
 		 2665 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  52.84 
 
 		 2955 aa  2168    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  37.13 
 
 		 2797 aa  1026    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  28.12 
 
 		 2327 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  24.17 
 
 		 2016 aa  338  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  25.06 
 
 		 2335 aa  335  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  27.69 
 
 		 1582 aa  335  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1557 aa  332  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  25.77 
 
 		 2331 aa  322  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  25.4 
 
 		 2052 aa  320  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  25.44 
 
 		 2252 aa  319  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1652 aa  308  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1411 aa  307  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1993 aa  275  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  29.73 
 
 		 2115 aa  271  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1874 aa  270  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.73 
 
 		 2025 aa  269  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1981 aa  267  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1799 aa  265  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1850 aa  264  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  28.78 
 
 		 1587 aa  196  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  19.22 
 
 		 1543 aa  174  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  28.62 
 
 		 764 aa  124  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1099 aa  63.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  33.12 
 
 		 691 aa  58.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  29.63 
 
 		 810 aa  55.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  24.07 
 
 		 787 aa  51.2  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  27.43 
 
 		 864 aa  51.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  28.47 
 
 		 2113 aa  50.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  19.09 
 
 		 7659 aa  50.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  26.83 
 
 		 1235 aa  48.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  29.08 
 
 		 677 aa  47.8  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>