34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4468 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  81.71 
 
 
2665 aa  4014    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  35.88 
 
 
3296 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  37.07 
 
 
2487 aa  895    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  100 
 
 
2797 aa  5305    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  40.21 
 
 
2955 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  99.18 
 
 
2797 aa  5262    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  27.24 
 
 
2327 aa  351  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  28.91 
 
 
1411 aa  321  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  28.22 
 
 
1652 aa  318  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  25.41 
 
 
2052 aa  308  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  27.71 
 
 
1587 aa  307  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  24.55 
 
 
2252 aa  302  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  33.53 
 
 
1582 aa  296  5e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  24.72 
 
 
2016 aa  293  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  33.53 
 
 
1557 aa  293  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  32.53 
 
 
1993 aa  291  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  24.55 
 
 
2331 aa  286  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  30.51 
 
 
1874 aa  278  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  31.42 
 
 
1799 aa  277  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  31.14 
 
 
2115 aa  275  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.8 
 
 
2025 aa  275  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  31.49 
 
 
1981 aa  273  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  30.88 
 
 
1850 aa  266  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  25.33 
 
 
2335 aa  241  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  20.27 
 
 
1543 aa  158  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  27.36 
 
 
764 aa  130  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  33.03 
 
 
1099 aa  63.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  29.36 
 
 
864 aa  59.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  29.37 
 
 
810 aa  56.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  29.35 
 
 
1235 aa  51.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  29.34 
 
 
691 aa  50.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  17.91 
 
 
7659 aa  50.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0522  hypothetical protein  16.45 
 
 
2166 aa  48.9  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  21.34 
 
 
707 aa  46.2  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>