39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1975 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1538  chemotaxis sensory transducer  36.85 
 
 		 2052 aa  921    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2187  hypothetical protein  90.38 
 
 		 2331 aa  3951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0475107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  100 
 
 		 2335 aa  4583    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2239  hypothetical protein  46.04 
 
 		 2252 aa  1850    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  26.85 
 
 		 2327 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_004310  BR1024  hypothetical protein  30.47 
 
 		 1557 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171459  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0990  hypothetical protein  30.68 
 
 		 1582 aa  439  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2111  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1587 aa  419  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1408  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1652 aa  417  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4932  Apolipoprotein A1/A4/E  24.38 
 
 		 2797 aa  314  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4468  hypothetical protein  24.55 
 
 		 2797 aa  311  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4123  hypothetical protein  27.1 
 
 		 1411 aa  310  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520835  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  26.1 
 
 		 2665 aa  296  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2348  hypothetical protein  25.09 
 
 		 2016 aa  292  6e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.357816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3845  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1981 aa  258  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4480  conserved hypothetical protein; putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.05 
 
 		 2025 aa  247  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1086  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1799 aa  231  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0392577  normal  0.564005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1641  hypothetical protein  27.36 
 
 		 2115 aa  221  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1318  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1850 aa  220  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1455  hypothetical protein  25.59 
 
 		 1993 aa  219  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.529974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0623  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1543 aa  213  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0275717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5554  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1874 aa  209  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  28.64 
 
 		 2955 aa  180  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6067  hypothetical protein  50.96 
 
 		 3296 aa  165  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2516  hypothetical protein  27.48 
 
 		 764 aa  155  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134134  normal  0.0151219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1948  hypothetical protein  47.13 
 
 		 2487 aa  140  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0909817 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2038  hypothetical protein  40.18 
 
 		 864 aa  88.2  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3207  hypothetical protein  37.5 
 
 		 810 aa  81.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.306587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3216  hypothetical protein  35.4 
 
 		 1099 aa  80.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0150  Apolipoprotein A1/A4/E  18.79 
 
 		 7659 aa  77  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1291  hypothetical protein  33.93 
 
 		 787 aa  73.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2601  hypothetical protein  22.42 
 
 		 708 aa  57  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2000  hypothetical protein  29.19 
 
 		 691 aa  54.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  24.33 
 
 		 785 aa  52.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  23.12 
 
 		 935 aa  51.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  27.18 
 
 		 1153 aa  51.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0145  TolA domain-containing protein  33.67 
 
 		 497 aa  50.8  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1018 aa  49.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1018 aa  49.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>