40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1284 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  84.06 
 
 
938 aa  1551    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  64.41 
 
 
872 aa  786    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  62.69 
 
 
935 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  58.39 
 
 
1095 aa  1111    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  63.29 
 
 
1015 aa  1161    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  100 
 
 
1018 aa  1986    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  82.67 
 
 
938 aa  1523    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  82.28 
 
 
938 aa  1515    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  100 
 
 
1018 aa  1986    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  84.06 
 
 
938 aa  1551    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  57.14 
 
 
935 aa  857    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  64.04 
 
 
1015 aa  1199    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  57.14 
 
 
935 aa  857    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  54.61 
 
 
1031 aa  983    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  56.46 
 
 
1045 aa  1010    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  69.37 
 
 
698 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  96.17 
 
 
858 aa  1234    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  85.49 
 
 
778 aa  962    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  63.84 
 
 
1015 aa  1200    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  68.18 
 
 
698 aa  632  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  61.39 
 
 
696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  54.8 
 
 
812 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  56.31 
 
 
876 aa  399  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.5 
 
 
785 aa  376  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  44.13 
 
 
723 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  44.13 
 
 
754 aa  325  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  35.3 
 
 
690 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.35 
 
 
1816 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  33.8 
 
 
563 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.36 
 
 
442 aa  51.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  35.8 
 
 
330 aa  49.7  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32 
 
 
495 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1975  Apolipoprotein A1/A4/E  24.41 
 
 
2335 aa  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320272  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  22.22 
 
 
696 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3548  Apolipoprotein A1/A4/E  23.77 
 
 
2327 aa  47  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.808301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  22.77 
 
 
549 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  29.76 
 
 
708 aa  45.8  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  32.59 
 
 
367 aa  45.8  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.36 
 
 
1896 aa  45.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 
667 aa  45.1  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>