34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0803 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  68.33 
 
 
938 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  70.16 
 
 
696 aa  934    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  90.36 
 
 
872 aa  874    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  68.33 
 
 
1018 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  69.17 
 
 
938 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  60.51 
 
 
938 aa  664    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  68.33 
 
 
1018 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  68.33 
 
 
938 aa  664    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  74.07 
 
 
698 aa  953    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  67.11 
 
 
1045 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  66.62 
 
 
778 aa  920    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  100 
 
 
698 aa  1371    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  68.33 
 
 
858 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  68.55 
 
 
935 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  68.55 
 
 
935 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  68.15 
 
 
1095 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  66.33 
 
 
935 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  66.33 
 
 
1015 aa  618  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  66.94 
 
 
1015 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  66.53 
 
 
1015 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  76.16 
 
 
812 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  60.92 
 
 
1031 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  49.93 
 
 
754 aa  565  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  45.29 
 
 
785 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  54.17 
 
 
876 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  45.94 
 
 
723 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  36.75 
 
 
690 aa  350  5e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  36.62 
 
 
563 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  25.54 
 
 
677 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.36 
 
 
442 aa  51.6  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  31.79 
 
 
330 aa  50.4  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 
495 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  28.77 
 
 
549 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.94 
 
 
696 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>