34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2737 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  100 
 
 
495 aa  986    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  42.83 
 
 
524 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  38.06 
 
 
563 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  37.6 
 
 
549 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  27.66 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  32 
 
 
476 aa  60.1  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  32 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  27.5 
 
 
330 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  38.38 
 
 
1787 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  32.69 
 
 
399 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  26.42 
 
 
392 aa  51.6  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  33.01 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  34.26 
 
 
391 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  33.72 
 
 
367 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  34.65 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  34.25 
 
 
723 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  34.26 
 
 
391 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  34.21 
 
 
708 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.01 
 
 
667 aa  48.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36 
 
 
442 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  26 
 
 
706 aa  47  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  26.17 
 
 
706 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  31.58 
 
 
569 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  37.38 
 
 
520 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  44.62 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
462 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  37.14 
 
 
462 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  37.14 
 
 
462 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
462 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  37.14 
 
 
462 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  28.22 
 
 
550 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  28.22 
 
 
550 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  28.22 
 
 
550 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>