51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3028 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1373    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  39.44 
 
 
723 aa  458  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  37.95 
 
 
696 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  34.13 
 
 
785 aa  342  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  38.11 
 
 
698 aa  333  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  36.47 
 
 
698 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  33.38 
 
 
778 aa  286  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  41.96 
 
 
1045 aa  247  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  40.71 
 
 
1031 aa  226  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  35.49 
 
 
938 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  32.74 
 
 
1015 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  35.12 
 
 
938 aa  220  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  35.12 
 
 
938 aa  220  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  32.81 
 
 
935 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  35.12 
 
 
1018 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  32.81 
 
 
935 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  35.12 
 
 
1018 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  35.12 
 
 
858 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  34.94 
 
 
938 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  36.13 
 
 
1015 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  32.46 
 
 
1015 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  35.92 
 
 
935 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  35.37 
 
 
1095 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  37.17 
 
 
872 aa  213  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  39.6 
 
 
812 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  34.71 
 
 
876 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  37.5 
 
 
754 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.79 
 
 
442 aa  57.4  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  23.93 
 
 
462 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  23.93 
 
 
462 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.93 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  24.66 
 
 
708 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  22.6 
 
 
677 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32.46 
 
 
495 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  22.81 
 
 
563 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  29.07 
 
 
330 aa  52.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  23.62 
 
 
462 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  20 
 
 
476 aa  50.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.28 
 
 
696 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 
362 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  20 
 
 
476 aa  49.3  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  22.49 
 
 
462 aa  48.9  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  27.56 
 
 
353 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  32.5 
 
 
377 aa  47.4  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  26.85 
 
 
589 aa  47  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  32.29 
 
 
524 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  27.12 
 
 
704 aa  45.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  31.43 
 
 
358 aa  45.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  35 
 
 
427 aa  45.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  23.78 
 
 
550 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  23.02 
 
 
550 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>