48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0504 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 723 aa  1439    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  42.58 
 
 		 778 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  46.83 
 
 		 696 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  38.93 
 
 		 690 aa  411  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  55.56 
 
 		 785 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  46.18 
 
 		 1045 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  46.52 
 
 		 872 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  47.32 
 
 		 698 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  45.92 
 
 		 938 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  45.94 
 
 		 698 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  45.51 
 
 		 858 aa  364  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  45.31 
 
 		 938 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  45.31 
 
 		 938 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  45.31 
 
 		 1018 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  45.31 
 
 		 1018 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  45.1 
 
 		 938 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  43.19 
 
 		 1015 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  44.86 
 
 		 935 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  44.86 
 
 		 935 aa  351  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  52.33 
 
 		 1031 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1015 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  50.24 
 
 		 1015 aa  335  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  49.88 
 
 		 935 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  50 
 
 		 1095 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  51.6 
 
 		 812 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  43.73 
 
 		 876 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  41.52 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  19.4 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  24.71 
 
 		 427 aa  55.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  30.16 
 
 		 392 aa  54.7  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  21.52 
 
 		 706 aa  54.3  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.26 
 
 		 442 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  21.11 
 
 		 706 aa  51.2  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  27.43 
 
 		 330 aa  51.2  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  19.83 
 
 		 696 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  36.03 
 
 		 677 aa  50.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  31.43 
 
 		 391 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  30.16 
 
 		 391 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  20.47 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  20.21 
 
 		 476 aa  50.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  34.25 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  30.46 
 
 		 708 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  26.62 
 
 		 399 aa  49.3  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  20.27 
 
 		 362 aa  48.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  31.4 
 
 		 589 aa  47.4  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  19.07 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  29.52 
 
 		 391 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  45.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>