31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0230 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  945    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  98.11 
 
 		 476 aa  931    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  24.51 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  25.81 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0320  hypothetical protein  22.54 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  26.94 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  23.04 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  27.89 
 
 		 549 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  23.4 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  23.62 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.29 
 
 		 362 aa  53.9  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  22.11 
 
 		 399 aa  53.5  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  32.94 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  28.45 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  26.05 
 
 		 391 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  26.05 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  20.59 
 
 		 723 aa  48.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  25.76 
 
 		 569 aa  48.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  20.9 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  26.74 
 
 		 320 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  20.73 
 
 		 542 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  31.03 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  36.49 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  36.49 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  36.49 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  36.49 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  36.49 
 
 		 462 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  30.49 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  38.3 
 
 		 358 aa  43.1  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  24.77 
 
 		 454 aa  43.1  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>