42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5052 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  54.52 
 
 
938 aa  946    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  60.24 
 
 
872 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  75.57 
 
 
935 aa  1371    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  79.31 
 
 
1095 aa  1582    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  100 
 
 
1015 aa  1980    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  63.3 
 
 
1018 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  54.81 
 
 
938 aa  952    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  58.06 
 
 
938 aa  1025    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  63.3 
 
 
1018 aa  1188    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  54.52 
 
 
938 aa  946    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  76.28 
 
 
935 aa  1385    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  87.59 
 
 
1015 aa  1697    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  76.28 
 
 
935 aa  1385    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  54.85 
 
 
1045 aa  960    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  62.25 
 
 
858 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  54.83 
 
 
1031 aa  959    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  88.77 
 
 
1015 aa  1721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  64.06 
 
 
778 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  66.53 
 
 
698 aa  592  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  64.11 
 
 
698 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  59.24 
 
 
696 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  53.4 
 
 
812 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  42.65 
 
 
723 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.04 
 
 
785 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  53.69 
 
 
876 aa  358  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  41.92 
 
 
754 aa  285  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  40.87 
 
 
690 aa  223  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  36.62 
 
 
563 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  28.7 
 
 
330 aa  53.5  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  25.94 
 
 
427 aa  52.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  36.03 
 
 
677 aa  52  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.06 
 
 
442 aa  50.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.33 
 
 
495 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  26.24 
 
 
392 aa  45.8  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  30.22 
 
 
391 aa  45.8  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  28.33 
 
 
462 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  30.22 
 
 
391 aa  45.8  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  28.33 
 
 
462 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  28.33 
 
 
462 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  28.33 
 
 
462 aa  45.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  28.33 
 
 
462 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  28.57 
 
 
549 aa  45.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>