34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2265 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  100 
 
 
754 aa  1458    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  49.42 
 
 
778 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  45.41 
 
 
858 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  47.72 
 
 
812 aa  580  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  49.8 
 
 
698 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  45.32 
 
 
696 aa  568  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  42.21 
 
 
938 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  46.35 
 
 
698 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  41.34 
 
 
785 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  37.73 
 
 
723 aa  416  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  45.73 
 
 
938 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  45.73 
 
 
938 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  45.73 
 
 
1018 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  45.73 
 
 
1018 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  45.48 
 
 
938 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  42.1 
 
 
1045 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  45.31 
 
 
872 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  53.13 
 
 
876 aa  375  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  43.46 
 
 
1015 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  43.1 
 
 
935 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  43.28 
 
 
935 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  43.1 
 
 
935 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  42.76 
 
 
1015 aa  364  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  42.42 
 
 
1095 aa  356  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  42.76 
 
 
1015 aa  353  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  40.97 
 
 
1031 aa  331  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  32.84 
 
 
690 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.36 
 
 
442 aa  50.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  32.5 
 
 
330 aa  50.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
708 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  35.71 
 
 
563 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  37.35 
 
 
392 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.5 
 
 
362 aa  46.6  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  27.85 
 
 
476 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>