51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3906 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  51.06 
 
 		 938 aa  851    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  67.69 
 
 		 872 aa  816    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  48.37 
 
 		 935 aa  810    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  50.71 
 
 		 1095 aa  916    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  54.85 
 
 		 1015 aa  955    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  56.45 
 
 		 1018 aa  1039    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  53.94 
 
 		 938 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  50.87 
 
 		 938 aa  875    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  56.45 
 
 		 1018 aa  1039    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  51.06 
 
 		 938 aa  851    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  50.38 
 
 		 935 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  53.44 
 
 		 1015 aa  950    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  50.38 
 
 		 935 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  61.08 
 
 		 1031 aa  1142    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  100 
 
 		 1045 aa  2035    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  53.87 
 
 		 858 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  54.62 
 
 		 1015 aa  980    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  56.5 
 
 		 778 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  67.45 
 
 		 698 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  60.3 
 
 		 696 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  62.18 
 
 		 698 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  52.39 
 
 		 812 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  46.77 
 
 		 723 aa  412  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.06 
 
 		 785 aa  386  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  50.34 
 
 		 876 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  41.16 
 
 		 754 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  34.06 
 
 		 690 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.84 
 
 		 2099 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  21.84 
 
 		 2099 aa  53.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.41 
 
 		 2010 aa  52  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.06 
 
 		 442 aa  50.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  35.29 
 
 		 677 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  48.9  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  31.82 
 
 		 706 aa  48.5  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  30.68 
 
 		 706 aa  48.1  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3894  putative sensor histidine kinase  20.94 
 
 		 590 aa  47.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  47.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  34.72 
 
 		 696 aa  47  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  32.94 
 
 		 589 aa  46.6  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  22.03 
 
 		 1839 aa  46.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 		 708 aa  46.2  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  22 
 
 		 1857 aa  46.2  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  19.73 
 
 		 1896 aa  45.8  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  36.47 
 
 		 427 aa  45.8  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  27.55 
 
 		 358 aa  45.4  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.73 
 
 		 1816 aa  45.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  29.21 
 
 		 335 aa  45.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  34.92 
 
 		 330 aa  44.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  26.29 
 
 		 399 aa  44.7  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  29.38 
 
 		 367 aa  44.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  32.05 
 
 		 377 aa  44.7  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>