46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3240 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  64.28 
 
 		 698 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  70.16 
 
 		 698 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  100 
 
 		 696 aa  1374    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  58.1 
 
 		 778 aa  783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  66.16 
 
 		 872 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  61.39 
 
 		 938 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  61.39 
 
 		 938 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  61.39 
 
 		 1018 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  61.39 
 
 		 1018 aa  585  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  61 
 
 		 938 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  61.39 
 
 		 858 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  60.3 
 
 		 1045 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  61 
 
 		 938 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  57.38 
 
 		 1031 aa  551  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  58.75 
 
 		 935 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  59.36 
 
 		 935 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  59.36 
 
 		 1095 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  58.75 
 
 		 1015 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  59.36 
 
 		 935 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  58.35 
 
 		 1015 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  45.19 
 
 		 754 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  59.24 
 
 		 1015 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  63.9 
 
 		 812 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.26 
 
 		 785 aa  495  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  46.83 
 
 		 723 aa  438  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  45.06 
 
 		 876 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  37.95 
 
 		 690 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  22.33 
 
 		 563 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  24.09 
 
 		 708 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  25.05 
 
 		 677 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  34.67 
 
 		 495 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.56 
 
 		 442 aa  50.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  32.5 
 
 		 330 aa  50.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  31.51 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.18 
 
 		 462 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  31.87 
 
 		 696 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.75 
 
 		 362 aa  45.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  18.44 
 
 		 476 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  36.49 
 
 		 589 aa  44.3  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  18.59 
 
 		 476 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  32.98 
 
 		 381 aa  43.9  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  35.29 
 
 		 367 aa  43.9  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>