38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0115 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  48.45 
 
 
1031 aa  690    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  100 
 
 
938 aa  1835    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  84.06 
 
 
1018 aa  1552    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  97.53 
 
 
938 aa  1739    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  65.13 
 
 
935 aa  1117    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  58.46 
 
 
1015 aa  1035    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  98.4 
 
 
938 aa  1800    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  84.06 
 
 
1018 aa  1552    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  58.01 
 
 
1015 aa  1001    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  65.13 
 
 
935 aa  1117    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  69.37 
 
 
698 aa  638    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  62.64 
 
 
1095 aa  857    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  85.49 
 
 
778 aa  963    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  65.31 
 
 
935 aa  1120    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  58.46 
 
 
1015 aa  1030    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  82.04 
 
 
858 aa  1384    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  59.5 
 
 
872 aa  938    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  48.44 
 
 
876 aa  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  100 
 
 
938 aa  1835    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  68.18 
 
 
698 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  61.39 
 
 
696 aa  583  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  54.8 
 
 
812 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  52.87 
 
 
1045 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  42.5 
 
 
785 aa  376  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  44.13 
 
 
723 aa  373  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  44.13 
 
 
754 aa  326  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  35.3 
 
 
690 aa  215  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  33.8 
 
 
563 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  36.36 
 
 
442 aa  51.2  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  35.8 
 
 
330 aa  49.7  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32 
 
 
495 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  18.31 
 
 
1816 aa  48.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  22.22 
 
 
696 aa  47.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  22.77 
 
 
549 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  32.59 
 
 
367 aa  45.8  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  29.76 
 
 
708 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24 
 
 
667 aa  44.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  38.2 
 
 
677 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>