48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5081 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1114  hypothetical protein  48.57 
 
 		 938 aa  805    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4484  protein of unknown function DUF802  58.61 
 
 		 872 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.519421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3559  hypothetical protein  50.94 
 
 		 935 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634418  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3867  hypothetical protein  50.36 
 
 		 1095 aa  884    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5052  hypothetical protein  55.13 
 
 		 1015 aa  942    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115568 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1284  hypothetical protein  54.54 
 
 		 1018 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.878781  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1701  hypothetical protein  48.57 
 
 		 938 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1787  methyl-accepting chemotaxis protein  49.51 
 
 		 938 aa  826    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0311  hypothetical protein  54.54 
 
 		 1018 aa  993    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0115  hypothetical protein  48.57 
 
 		 938 aa  805    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3654  hypothetical protein  51.08 
 
 		 935 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609999  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5400  hypothetical protein  54.38 
 
 		 1015 aa  951    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4709  hypothetical protein  51.08 
 
 		 935 aa  831    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  100 
 
 		 1031 aa  2003    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  61.08 
 
 		 1045 aa  1132    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0266  hypothetical protein  53.91 
 
 		 858 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.573824  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2457  hypothetical protein  55.57 
 
 		 1015 aa  974    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.599708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1149  hypothetical protein  52.25 
 
 		 778 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0881428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0803  putative transmembrane protein  62.67 
 
 		 698 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3240  protein of unknown function DUF802  57.38 
 
 		 696 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.701112  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03062  hypothetical protein  58.88 
 
 		 698 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6428  hypothetical protein  63.4 
 
 		 812 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  52.33 
 
 		 723 aa  360  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2102  hypothetical protein  40.16 
 
 		 785 aa  361  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04091  hypothetical protein  50.37 
 
 		 876 aa  343  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2265  protein of unknown function DUF802  40.35 
 
 		 754 aa  283  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3028  hypothetical protein  35.07 
 
 		 690 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.66 
 
 		 442 aa  56.2  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  31.73 
 
 		 563 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  24.8 
 
 		 708 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  28.33 
 
 		 399 aa  51.6  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  29.11 
 
 		 330 aa  50.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  33.96 
 
 		 392 aa  50.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  21.74 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  26.28 
 
 		 816 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  30.34 
 
 		 677 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  27.36 
 
 		 549 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  35.62 
 
 		 495 aa  49.3  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  20.7 
 
 		 706 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  32.43 
 
 		 427 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  28.85 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  34.44 
 
 		 589 aa  47.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  26.96 
 
 		 358 aa  46.2  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 462 aa  45.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  34.18 
 
 		 462 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 462 aa  45.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  34.18 
 
 		 462 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.18 
 
 		 462 aa  45.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>