20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4267 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  27.94 
 
 		 730 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  31.21 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  27.66 
 
 		 739 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.03 
 
 		 667 aa  195  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  29.76 
 
 		 688 aa  184  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  30.94 
 
 		 1787 aa  98.6  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  24.47 
 
 		 677 aa  87.4  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  24.56 
 
 		 696 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  22.42 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  22.18 
 
 		 706 aa  77.8  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  23.28 
 
 		 708 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  23.94 
 
 		 685 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  24.26 
 
 		 589 aa  50.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  19.82 
 
 		 704 aa  48.5  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1113  phage infection protein  20.51 
 
 		 1111 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1238  phage infection protein  22.43 
 
 		 924 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  19.18 
 
 		 657 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0992  hypothetical protein  20.96 
 
 		 923 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  20.46 
 
 		 563 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>