53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2941 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  849    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  59.84 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  54.87 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  54.55 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  53.96 
 
 		 391 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  54.22 
 
 		 391 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  52.85 
 
 		 569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  34.79 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  35.2 
 
 		 377 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  39.27 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  40.75 
 
 		 320 aa  177  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  44.59 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.06 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  38.27 
 
 		 359 aa  159  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  38.03 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  42.44 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  43.43 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  42.86 
 
 		 353 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  43.39 
 
 		 333 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  43.91 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  33.86 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  47.28 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  38.76 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  44.5 
 
 		 358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  37.85 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  46.15 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  43.9 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  41.99 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  42.08 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.16 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  40.79 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  35.17 
 
 		 324 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  38.51 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  44.4 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  48.22 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  40.09 
 
 		 330 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  37.92 
 
 		 334 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  37.92 
 
 		 331 aa  130  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  37.29 
 
 		 328 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  23.12 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  22.61 
 
 		 476 aa  53.9  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  26.4 
 
 		 723 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  33.01 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  25.69 
 
 		 445 aa  50.1  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.17 
 
 		 667 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.43 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  25.14 
 
 		 462 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  25 
 
 		 524 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  26.23 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  26.23 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  26.23 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  26.23 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  31.17 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>