47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1039 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  785    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  54.08 
 
 
392 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  54.03 
 
 
427 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  51.32 
 
 
391 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  50.53 
 
 
391 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  50.53 
 
 
391 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  48.95 
 
 
569 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  35.71 
 
 
377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  38.43 
 
 
330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.93 
 
 
442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  38.77 
 
 
359 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  39.13 
 
 
328 aa  152  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  38.84 
 
 
333 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  38.71 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  32.9 
 
 
362 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  35.9 
 
 
381 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  35.76 
 
 
368 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  39.04 
 
 
332 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  38.53 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  42.44 
 
 
320 aa  139  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  38.5 
 
 
353 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  40.53 
 
 
324 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  38.51 
 
 
337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  33.9 
 
 
358 aa  137  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  41.92 
 
 
335 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  37.61 
 
 
349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  36.09 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  37.37 
 
 
337 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  35.34 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  35.29 
 
 
367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  33.68 
 
 
328 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  34.66 
 
 
328 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  38.32 
 
 
349 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  33.67 
 
 
330 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  39.32 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  44.67 
 
 
359 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  35.94 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  33.11 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  33.11 
 
 
331 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  29.37 
 
 
563 aa  63.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  25.94 
 
 
524 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  23.16 
 
 
476 aa  57.4  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.14 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  22.11 
 
 
476 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  25.25 
 
 
495 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  26.62 
 
 
723 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  21.22 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>