26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0451 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  100 
 
 
589 aa  1186    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  32.01 
 
 
550 aa  263  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  32.01 
 
 
550 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  31.85 
 
 
550 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  25.51 
 
 
520 aa  157  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  26.69 
 
 
367 aa  110  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6678  hypothetical protein  26.16 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000129285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  35.56 
 
 
456 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  36.11 
 
 
706 aa  55.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  34.21 
 
 
706 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  38.96 
 
 
730 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  39.39 
 
 
739 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  39.74 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  32.1 
 
 
696 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  25.29 
 
 
708 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  42.19 
 
 
454 aa  50.4  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  24.26 
 
 
816 aa  50.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  39.71 
 
 
677 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.8 
 
 
667 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  31.4 
 
 
723 aa  47.4  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  34.67 
 
 
483 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  34.67 
 
 
480 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  34.67 
 
 
480 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0912  hypothetical protein  35.9 
 
 
443 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.214315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  33.85 
 
 
688 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  31.51 
 
 
1787 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>