22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4618 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 730 aa  1470    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  53.63 
 
 		 739 aa  769    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  36.09 
 
 		 688 aa  426  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  28.18 
 
 		 816 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.92 
 
 		 667 aa  269  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  27.83 
 
 		 666 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  32.68 
 
 		 1787 aa  134  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  23.37 
 
 		 677 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  25 
 
 		 706 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  24.42 
 
 		 706 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  22.67 
 
 		 696 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  23.47 
 
 		 708 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  19.92 
 
 		 657 aa  74.7  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  25.81 
 
 		 685 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  21.6 
 
 		 704 aa  57.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  38.96 
 
 		 589 aa  53.5  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  31.63 
 
 		 261 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  20.5 
 
 		 520 aa  48.1  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  38.98 
 
 		 367 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  20.46 
 
 		 550 aa  45.8  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  20.27 
 
 		 550 aa  45.8  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  20.46 
 
 		 550 aa  45.8  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>