28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4824 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  99.09 
 
 		 550 aa  1112    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1120    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  99.09 
 
 		 550 aa  1111    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  32.01 
 
 		 589 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  25.43 
 
 		 520 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  30.88 
 
 		 367 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  22.29 
 
 		 677 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  26.13 
 
 		 708 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6678  hypothetical protein  32.53 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000129285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  37.5 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0912  hypothetical protein  40.26 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.214315  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  37.66 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  18.99 
 
 		 688 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  31.17 
 
 		 739 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.15 
 
 		 667 aa  48.9  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  31.75 
 
 		 706 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  31.75 
 
 		 706 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2071  hypothetical protein  45.1 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  38.71 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  21.75 
 
 		 696 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  38.71 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  38.71 
 
 		 480 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1219  hypothetical protein  40.32 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  26.22 
 
 		 359 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6604  hypothetical protein  20.32 
 
 		 2955 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1216  hypothetical protein  36.23 
 
 		 387 aa  44.3  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0162569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  28.22 
 
 		 495 aa  44.3  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>