59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3368 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3368  MotA  100 
 
 
359 aa  710    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1074  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.82 
 
 
442 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0210036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1709  hypothetical protein  42.86 
 
 
377 aa  257  2e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.288619  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2262  MotA/TolQ/ExbB proton channel family  47.9 
 
 
381 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2830  hypothetical protein  43.85 
 
 
328 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712159  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1503  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  47.31 
 
 
362 aa  226  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4337  hypothetical protein  42.3 
 
 
333 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0593676  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0992  hypothetical protein  51.28 
 
 
339 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2743  hypothetical protein  43.91 
 
 
358 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.171341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2096  hypothetical protein  41.03 
 
 
392 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2585  hypothetical protein  42.31 
 
 
330 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3541  hypothetical protein  42.41 
 
 
353 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6938  hypothetical protein  42.62 
 
 
330 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4487  hypothetical protein  41.44 
 
 
332 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2159  hypothetical protein  48.34 
 
 
324 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2664  hypothetical protein  46.38 
 
 
368 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636064  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3343  hypothetical protein  45.33 
 
 
353 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.41153  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0801  hypothetical protein  52.97 
 
 
335 aa  189  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2099  hypothetical protein  43.75 
 
 
320 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157749  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1039  hypothetical protein  38.77 
 
 
399 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0323  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  48.33 
 
 
242 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2941  hypothetical protein  38.27 
 
 
427 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0937923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2209  hypothetical protein  41.5 
 
 
391 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3187  hypothetical protein  56.03 
 
 
337 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.91365  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2288  hypothetical protein  38.59 
 
 
391 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0847  hypothetical protein  45.59 
 
 
359 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.164957  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0964  hypothetical protein  38.59 
 
 
391 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0530307  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3671  hypothetical protein  47.19 
 
 
337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.673224  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1204  hypothetical protein  54.77 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3074  hypothetical protein  41.84 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2317  hypothetical protein  40.78 
 
 
330 aa  159  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0554801  normal  0.125751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3255  hypothetical protein  45.79 
 
 
367 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_004310  BR1713  hypothetical protein  52.67 
 
 
349 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2638  hypothetical protein  39.78 
 
 
331 aa  156  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2361  hypothetical protein  39.78 
 
 
334 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.261278 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3552  hypothetical protein  50.21 
 
 
368 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4542  hypothetical protein  39.79 
 
 
328 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5364  hypothetical protein  43.93 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.725258  decreased coverage  0.00123752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1405  hypothetical protein  41.63 
 
 
569 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2438  hypothetical protein  33.17 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1193  MotA/TolQ/ExbB proton channel  21.47 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0230  hypothetical protein  30.43 
 
 
476 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0231  hypothetical protein  31.3 
 
 
476 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  26.02 
 
 
524 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  28.64 
 
 
723 aa  60.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  29.41 
 
 
549 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32.14 
 
 
495 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  25.71 
 
 
550 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4517  putative integral membrane protein  41.43 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4653  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.43 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0572045  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4508  putative integral membrane protein  41.43 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.48653  normal  0.86135 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4602  hypothetical protein  41.43 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4603  putative integral membrane protein  41.43 
 
 
462 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.156774  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  26.74 
 
 
550 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  26.74 
 
 
550 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  24.57 
 
 
563 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3906  hypothetical protein  35 
 
 
1045 aa  47  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.175039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1868  MotA/TolQ/ExbB proton channel  22.27 
 
 
474 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5081  hypothetical protein  34.85 
 
 
1031 aa  43.1  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.254827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>