28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003239 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1415    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  49 
 
 		 696 aa  655    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  96.6 
 
 		 706 aa  1370    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  29.4 
 
 		 708 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  25 
 
 		 730 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  20.39 
 
 		 677 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4588  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.18 
 
 		 667 aa  85.9  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4267  hypothetical protein  22.42 
 
 		 816 aa  78.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  20.48 
 
 		 739 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  25.5 
 
 		 1787 aa  70.5  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2232  hypothetical protein  26.14 
 
 		 261 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1007  hypothetical protein  25 
 
 		 666 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0987  hypothetical protein  22.98 
 
 		 704 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  26.74 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  25.11 
 
 		 367 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  21.02 
 
 		 688 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1071  hypothetical protein  25 
 
 		 657 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  36.11 
 
 		 589 aa  55.8  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0504  hypothetical protein  21.52 
 
 		 723 aa  54.3  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  25.48 
 
 		 454 aa  51.6  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3304  hypothetical protein  23.68 
 
 		 685 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  31.75 
 
 		 550 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  31.75 
 
 		 550 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  31.75 
 
 		 550 aa  48.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  27.71 
 
 		 563 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  26.17 
 
 		 495 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  28.85 
 
 		 549 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  28.57 
 
 		 524 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>