30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1501 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1501  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  716    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4824  hypothetical protein  29.06 
 
 
550 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3888  hypothetical protein  29.06 
 
 
550 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5803  hypothetical protein  29.06 
 
 
550 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485501  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0008  hypothetical protein  26.51 
 
 
520 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.556224  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0451  hypothetical protein  30.39 
 
 
589 aa  88.6  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.163567  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003239  hypothetical protein  25.11 
 
 
706 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1362  hypothetical protein  24.84 
 
 
706 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6678  hypothetical protein  48 
 
 
472 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000129285  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1071  hypothetical protein  28.57 
 
 
483 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.687156  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0701  hypothetical protein  28.57 
 
 
480 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0626  hypothetical protein  28.57 
 
 
480 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0912  hypothetical protein  23.4 
 
 
443 aa  55.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.214315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3879  hypothetical protein  52.63 
 
 
456 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1219  hypothetical protein  22.36 
 
 
390 aa  52.8  0.000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3785  hypothetical protein  24.75 
 
 
696 aa  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0516  hypothetical protein  28.1 
 
 
441 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1216  hypothetical protein  23.21 
 
 
387 aa  50.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0162569  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2936  hypothetical protein  27.78 
 
 
677 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.771094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2737  hypothetical protein  32.22 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414891  normal  0.112498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1849  hypothetical protein  23.11 
 
 
524 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677137  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0996  chromosome segregation ATPases-like protein  35.82 
 
 
1787 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.75117  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3414  hypothetical protein  33.33 
 
 
454 aa  46.6  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6042  methyl-accepting chemotaxis protein  34.29 
 
 
708 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1706  hypothetical protein  22.71 
 
 
563 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4618  hypothetical protein  38.98 
 
 
730 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.128897  hitchhiker  0.000000815627 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2071  hypothetical protein  43.64 
 
 
437 aa  45.1  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4289  hypothetical protein  28.77 
 
 
549 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0285  hypothetical protein  36.51 
 
 
739 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0953  hypothetical protein  40 
 
 
688 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000473513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>